Konkurs na stanowisko DOKTORANTA – STYPENDYSTY w Projekcie NCN SONATA-19

Konkurs na stanowisko doktoranta/tki stypendysty w Projekcie NCN SONATA-19 (nr umowy UMO-2023/51/D/NZ6/00745) pt. „Bakteryjne pęcherzyki i aktywacja kaspazy 4 w komórkach śródbłonka wywołują sekrecję pęcherzyków zewnątrzkomórkowych o właściwościach immunomodulujących – badanie proteomiczne”.

Nazwa stanowiska: DOKTORANT – STYPENDYSTA

Opis projektu:

W badaniach chcemy zastosować spektrometrię mas i bioinformatykę do dogłębnej, kontekstowej analizy białek pęcherzykowych z komórek śródbłonka w odpowiedzi na transfekcję LPS i pęcherzyki bakteryjne. Analiza zmian w sekrecji białek podczas rozwoju procesu zapalnego i poddanie ich bioinformatycznym analizom pozwoli na określenie biologicznych procesów zaangażowanych w wydzielanie białek i sygnałowanie w niekanonicznej odpowiedzi zapalnej. Proponowane badania pomogą opisać nowy mechanizm indukcji odpowiedzi zapalnej w komórkach śródbłonka naczyń, jaka może towarzyszyć wczesnym etapom rozwoju stanu zapalnego w miażdżycy. Analiza przesyłu sygnału może zaowocować zidentyfikowaniem nowych celów molekularnych dla terapii przeciwzapalnej w rozwoju miażdżycy. Pokazanie że bakteryjne pęcherzyk(krążące w krwiobiegu pacjentów z porowatością jelit czy periodontopatią) mogą aktywować kaspazy-4 i zależną od niej sekrecję pęcherzyków i IL-18 w drodze pyroptozy byłoby przełomem w rozumieniu patogenezy procesu zapalnego śródbłonka. Opisanie funkcjonowania kaspazy-4 w komórkach nieleukocytarnych znacznie poszerzyłoby wiedzę na temat funkcjonowania wrodzonej odporności, stanowiąc odpowiednik „niekanonicznego inflamasomu” w komórkach śródbłonka. Analiza czynników pęcherzykowych wydzielanych przez komórki śródbłonka naczyń pomoże zrozumieć procesy zaangażowane w rozwój wczesnych zmian miażdżycowych.

Wymagania:

• Posiadanie tytułu magistra nauk biologicznych, medycznych lub pokrewnych, lub planowanie uzyskania go najpóźniej do 30.09.2024;
• Status doktoranta w Szkole Doktorskiej BioMedChem lub gotowość rekrutacji do tej Szkoły;
• Samodzielność, entuzjazm i ciekawość naukowa;
• Skrupulatność i dobra organizacja;
• Gotowość do stałego pogłębiania wiedzy i krytycznego podejścia do tematyki;
• Umiejętność pracy w zespole;
• Bardzo dobra znajomość języka angielskiego w mowie i piśmie;
• Mile widziane doświadczenie w pracy z komórkami ssaczymi i podstawowa znajomość technik biochemicznych (Western blot, ELISA);
• Mile widziana znajomość metod proteomicznych i bioinformatycznej analizy danych proteomicznych.

Opis zadań:

• Izolacja i hodowla komórek z kożuchów leukocytarno-płytkowych;
• Hodowla podstawowych linii komórkowych i prowadzenie eksperymentów na komórkach w warunkach in vitro;
• Izolacja pęcherzyków zewnątrzkomórkowych przez ultrawirowanie;
• Analizy białkowe lizatów i pęcherzyków (SDS-PAGE, Western blot, ELISA);
• Zdobycie wiedzy w zakresie analiz proteomicznych i bioinformatycznej obróki danych;
• Przygotowywanie raportów i publikacji naukowych.

Warunki zatrudnienia:

• Stypendium na maksymalnie 36 miesięcy (okres próbny: 6 mies), z możliwością przedłużenia
• Ciekawa praca w młodym zespole;
• Współpraca z zagranicznymi ośrodkami w Finlandii i Norwegii, z możliwością wizyt naukowych;
• Nauka technik hodowli komórkowych i biochemicznych analiz białek od podstaw.

Kierownik projektu: dr inż. Wojciech Cypryk

Liczba stanowisk: 1

Wymagane dokumenty:

• List motywacyjny;
• CV/Życiorys;
• Jeżeli dostępne – dyplom magisterski;
• Krótki opis dotychczasowych zainteresowań, doświadczeń i osiągnięć w pracy naukowej (w szczególności w realizacji pracy licencjackiej/magisterskiej).

Termin składania ofert: 15.10.2024

Termin rozstrzygnięcia konkursu: 30.10.2024

Orientacyjna data rozpoczęcia pracy: 1.11.2024

Forma składania ofert: Zgłoszenia na konkurs należy przesyłać na adres e-mail: , do wiadomości: , temat: “konkurs na doktoranta w projekcie NCN”, załączenie wymaganych dokumentów w formacie PDF. W trakcie postepowania konkursowego wybrani kandydaci mogą być zaproszeni na rozmowę kwalifikacyjną.

Prosimy o dopisanie w dokumentach aplikacyjnych następującej klauzuli: „Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych przez Centrum Badań Molekularnych i Makromolekularnych Polskiej Akademii Nauk z siedzibą w Łodzi, NIP: 7240004662, ul. Sienkiewicza 112, 90-363 Łódź, w celu przeprowadzenia niniejszego procesu rekrutacyjnego.”

Klauzula informacyjna:

Administratorem Twoich danych osobowych jest Centrum Badań Molekularnych i Makromolekularnych Polskiej Akademii Nauk z siedzibą w Łodzi, NIP: 7240004662 („Instytut”). Instytut będzie przetwarzać Twoje dane w celu realizacji działalności naukowo – badawczej, świadczenia usług i kontaktu z Instytutem, na podstawie umowy (w związku z wykonaniem umowy lub w celu podjęcia działań na Twoje żądanie przed zawarciem umowy – art. 6 ust. 1 lit. b RODO), prawnie uzasadnionego interesu Instytutu (art. 6 ust. 1 lit. f RODO) oraz przepisów prawa (art. 6 ust. 1 lit. c RODO) – w zależności od okoliczności. Przysługuje Ci prawo: żądania dostępu do danych, otrzymywania ich kopii; sprostowania (poprawiania); usunięcia; ograniczenia przetwarzania; przenoszenia; wniesienia skargi do organu nadzorczego; wycofania zgody na przetwarzanie w dowolnym momencie (cofnięcie zgody nie wpływa na zgodność z prawem przetwarzania, którego dokonano przed jej wycofaniem) lub wniesienia sprzeciwu wobec przetwarzania danych.

Zastrzegamy sobie prawo do odwołania konkursu bez podania przyczyn.